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内设机构

秘书处	办公室	政策法规与改革处	发展规划处
计划财务处	乡村产业发展处	农村社会事业促进处	农村合作经济指导处
扶贫规划处	扶贫协作与老区建设处	扶贫开发指导处	市场与信息化处
农产品质量安全监管处	种植业管理处	畜牧与饲料处	兽医与屠宰管理处
渔业资源保护处	渔业发展处	港澳流动渔民工作处	种业管理处
农业机械化管理处	农田建设管理处	植保植检处（农药管理处）	农业综合执法监督处
科技教育处	交流合作处	人事处	离退休人员服务处（关工委）
机关党委	海洋综合执法总队

直属机构

农业有害生物预警防控中心	耕地肥料总站	农业技术推广总站	动物疫病预防控制中心
畜牧技术推广总站	动物防疫物资储备中心	现代农业装备研究所	农机试验鉴定站
农机化技术推广总站	农业环保与农村能源总站	农产品质量安全中心	农业展览馆（农业对外经济...
农民专业合作推广中心	农业投资项目中心	广州国家现代农业产业科技...	农业面源污染治理项目管理...
海洋渔业试验中心	渔业种质保护中心	渔业技术推广总站	港澳流动渔民接待站